Очень хорошая библиотека для разработки web приложений с использованием многооконности на JS находится по адресу http://prototype-window.xilinus.com/

Основные возможности:

• многооконность
• ресайз окошек и их перетаскивание
• модальные диалоги
• поддержка скинов
• визуальные эффекты
• и многое другое...

Работать с библиотекой очень просто, вот пример создания окна на JavaScript:

1. подключаем "оконные" скрипты 

   <script type="text/javascript" src="/javascripts/prototype.js"> </script>
     <script type="text/javascript" src="/javascripts/window.js"> </script>
   
   

2. Подключаем общие стили окон и тему

   <link href="/stylesheets/themes/default.css" rel="stylesheet" type="text/css"/>
   
     <!--  add this to have a specific theme-->
     <link href="themes/mac_os_x.css" rel="stylesheet" type="text/css"/>

3. Создаём новое окошко и пишем в него hello world и показываем его по центру

   win = new Window({className: "mac_os_x", title: "Sample", width:200, 
   height:150, destroyOnClose: true, recenterAuto:false});
   
     win.getContent().update("<h1>Hello world !!</h1>");
     win.showCenter();
   

скачать библиотеку окон, почитать документацию, посмотреть примеры работы оконной библиотеки